在十七世纪，哲学家笛卡尔认为松果腺体是灵魂所在的位置，是灵魂与肉体结合的地方，现代科学的说法是，松果腺体是分泌血清素及褪黑激素的重要腺体。

血清素及褪黑激素可调整睡眠、体温情绪、青春期及卵巢的周期，提高免疫系统活力和消除自由基的作用，治疗糖尿病及骨质疏松症等。

由于松果腺体是人体第六内分泌腺体，当松果腺体分泌正常时，它会控制其他第一至第五内分泌腺体，例如男女的性腺、肾上腺、胰岛腺、胸腺、甲状腺等。

松果腺体依据对光的感应来制造褪黑激素，光线越多其分泌量就越少。

有些动物的松果腺，是由皮肤直接感应光线。

人类的松果腺深埋在大脑内，所以是由眼睛接收光的信息。

不论通过哪一种管道，这个腺体与太阳升落同步作业，是控制睡眠周期的关键。

人的第三眼已经变成一个极为独特的、专门的腺体，人体中除了松果腺体以外，再也没有其他腺体具有星形细胞。

星形细胞不是普通的细胞，它在大脑半球中含量十分丰富。

至于腺体和神经细胞究竟为什么会盘根错节地缠绕在一起，人们还不是很清楚。

第三眼的功能和另两只眼相比虽然功能迥异，但还是有点“藕断丝连”，松果腺体对太阳光有敏感性他通过神经纤维眼睛相联系。

松果腺体在太阳光十分强烈时受阳光抑制，分泌松果激素较少；

反之，碰到阴雨连绵的天气，松果腺体就会分泌较多的松果激素。

此外，人们发现在第三眼的组织结构中含有钙、镁、磷、铁等晶体颗粒，刚出生的婴儿根本没有这种奇怪的称之为“脑砂”的东西。

在15岁以内的孩子中极为少见，但15岁以后“脑砂”的数量开始逐年增加，在第三眼中有那么一小堆沙子，竟丝毫不会影响它本身的功能。

而事实上，松果体根本就不是用来感光的，它是用来感应能量的！

松果体被称之为人类的第三只眼，又称之为真实之眼或智慧之眼。

在此基础上，一些教育机构开发出了所谓的“全脑开发”教程。