金人放回秦桧，宋高宗任其为礼部尚书，后升任参知政事。

期间秦桧排挤宰相范宗尹，使其罢相，秦桧请封自己为宰相。

绍兴元年（1131年）八月，秦桧被任命为右仆射、同中书门下平章事兼知枢密院事。

后与吕颐浩结党争权，吕颐浩回朝后，任用黄龟年等人弹劾秦桧，秦桧被罢相，任观文殿学士，提举江州太平观。

绍兴五年（1135年），完颜昌主政金廷，和议达成，秦桧复任资政殿学士等职。

绍兴八年（1138年）三月，秦桧任右仆射、同中书门下平章事兼枢密使。

金派使者来和议，宋高宗极力希望促成和议，秦桧与高宗密约由自己主持和议之事，不再由其他朝臣过问。

赵鼎因立嗣之事请辞相位，秦桧独揽朝中大权。

朝中凡是不主张和议之人皆被排挤。

金廷使者至临安，秦桧怕被谴责，与使者改“江南”为宋，称“诏谕”为国信。

高宗不愿向金人行屈膝礼，命秦桧以宰相身份行礼接受金廷国书。

和议后金人归还河南、陕西旧地，但一些大臣认为求和非长久之计，秦桧得知后罢免了一批人。

次年金人背盟南侵，秦桧的相位却得以稳固，他还力主撤兵并诏回岳飞。

南宋撤军后，金兵接连占领各地，秦桧被封为莘国公。

绍兴十一年（1141年），秦桧欲尽收诸将兵权，在给事中范同建议下，秦桧密奏高宗对韩世忠、张俊、岳飞三人论功行赏，解除他们的兵权。

六月，秦桧被封为左仆射、同中书门下平章事兼枢密使，进为庆国公，后因修成《徽宗实录》，迁少保并加封冀国公。

十月起，秦桧命人接连上疏弹劾岳飞，又指示张俊诬告岳飞手下张宪谋反，致使岳飞父子被逮捕入大理寺。

因岳飞常反对和议，秦桧命人诬告其“谩侮皇上”“受诏不救淮西”，于十二月将岳飞赐死狱中，岳飞之子岳云被斩杀。