李世贤则负责扫荡整个湾区内部的城市从费列蒙到奥克兰，从匹兹堡到里士满。

一天之内，美国在旧金山湾区的海军全部覆灭，黄呈忠突破金门海峡进入旧金山湾，配合陆军开始挨个轰炸内部的城镇。

陈炳文则在旧金山半岛两侧沿岸轰炸城镇。

第二天，黄呈忠的军舰到达卡基尼斯海峡之后，陈玉成立即掉头北上，带领军队向斯帕克斯和卡森城一带进军，拿下那里作为防线。

李世贤继续在湾区进行扫荡，战事虽然不胶着，这些城镇都不是太平军的一合之敌，但是城镇的居民大多数都是倾家荡产来西部的，百分之八十都是男性，都是来赌博命运的，还有一些就是别的国家的逃犯，在这里洗白藏匿，他们抵抗的决心也是很强。

无论他们抵抗的决心多强，也比不上太平军要在这里立足的决心，一支没有回头路的战争机器遇到抵抗注定是要靠杀戮开道。

李世贤在湾区杀了三天，可以说是血流成河，几乎杀了所有抵抗的白人男性，只放过了一些女性和从属的印第安人仆役。

阮文海没有参与湾区之战，只是近距离观察，只要太平军海上没有遇到对手，他就不会下场，毕竟这是属于太平军的战争。

三天之后，旧金山湾区所有城镇基本被战争机器犁了一遍，从夏威夷和阿拉斯加开始运送家属到湾区打扫战场，维修房屋，接手金矿。

黄呈忠上岸开始带领陆军南下，陈炳文则率舰队南下，进攻洛杉矶和拉斯维加斯一带，构筑南方防线。

李世贤则居中开始调度，对占领区开始调度和经营。首先是安置家属，然后是会见各印第安部落首领讨论领地问题。

此时，北线已经进入深秋，库页岛也不可能再向阿拉斯加移民，黄呈忠南下的时候，留下了1万士兵和5000家属，还有三艘军舰，粮食也留了足够渡过冬天的数量。